Для исключения вторичного загрязнения ампулы после мойки сразу же направляют на сушку или стерилизацию.
Сушка проводится в специальных сушильных шкафах при температуре 120—130 °С в течение 15—20 мин. При необходимости стерилизации ампулы помещаются в суховоздушный стерилизатор и в течение часа выдерживаются при температуре 180 °С. Важной особенностью является место размещения стерилизатора. Самым благоприятным будет являться положение, при котором загрузка вымытых ампул проводится в моечном отделении, а выгрузка высушенных и простерилизованных — в помещении I класса чистоты (отделении наполнения ампул раствором). Желательно использовать стерилизаторы с ламинарным потоком нагретого стерильного воздуха.
Особенностью их работы является то, что воздух подается с небольшим избыточным давлением в калорифер, нагревается до температуры 180—300 °С, проходит через стерилизующие фильтры и распределительное устройство, после чего поступает в стерилизационную камеру, распространяясь по всему сечению камеры в виде ламинарного потока.